Proteínas to Proteínas BLAST (blastp)

Nueva Búsqueda de BLAST

Introduce la(s) secuencia(s) de Proteínas que deseas comparar

Ingresa una o más consultas en el cuadro de texto superior o usa el botón Examinar para cargar un archivo desde tu disco local. El archivo puede contener una sola secuencia o una lista de secuencias. En ambos casos, los datos deben estar en formato FASTA. .

Mostrar una secuencia de ejemplo

Introduce la(s) secuencia(s) en formato FASTA

Introduce tu(s) secuencia(s) en este marco.

Escoge Base de Datos para la Búsqueda

Elije una de las bases de datos de protein BLAST que se enumeran a continuación.

Proteínas BLAST Databases:

Opciones Avanzadas

General parameters

Max target sequences:

Select the maximum number of aligned sequences to display

e-value(Expect threshold)

Expected number of chance matches in a random model.

Word size:

The length of the seed that initiates an alignment

Max matches in a query range

Limit the number of matches to a query range. This option is useful if many strong matches to one part of a query may prevent BLAST from presenting weaker matches to another part of the query.

Scoring parameters

Matrix

Assigns a score for aligning pairs of residues, and determines overall alignment score..

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