BÚSQUEDA DE SIMILITUDES EN SECUENCIAS

En bioinformática, BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) es un algoritmo para comparar información primaria de secuencias biológicas, tales como las secuencias de amino ácidos de diferentes proteínas o los nucleótidos de las secuencias de ADN. Una búsqueda BLAST le permite al investigador comparar una secuencia de consulta con una biblioteca o base de datos de secuencias e identificar secuencias en la biblioteca que se asemejan a la secuencia de consulta por encima de un cierto umbral. Hay diferentes tipos de BLAST disponibles según las secuencias de consulta. Por ejemplo, después del descubrimiento de un gen previamente desconocido en el ratón, un científico generalmente realizará una búsqueda BLAST del genoma humano para ver si los humanos portan un gen similar. El programa BLAST identificará secuencias en el genoma humano que se asemejan al gen del ratón en función de la similitud de la secuencia.

Altschul,S.F., Gish,W., Miller,W., Myers,E.W. and Lipman,D.J. (1990) Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol., 215, 403–410.

Búsqueda de BLAST

Busque una o más de sus secuencias (usando BLAST). Primero, elija un tipo de consulta (nucleótido o proteína). Podrás establecer parámetros de búsqueda en la página siguiente. Elige el programa apropiado según el tipo de consulta y el tipo de base de datos que quieras interrogar. Haz clic en el nombre del programa para ver el formulario de búsqueda.